祖家军上下自成体系，在晋朝时，即便主力一度被改编为中军，但除非负责宿卫的部分，否则也只听祖逖一人之命，尚书省是根本插不进手去的。但既然华晋禅代，祖逖又臣从了裴该，自然不可能再沿用旧例，裴该对于保证其军的完整性给出了承诺，祖士稚自然也不得不做一定程度的让步。
首先是要按照朝廷的军事体系重新编组，增加排、部、旅三个层级，排以上将吏名单都须上报枢密省备案其次于队以上各级设置司马，一方面核实功过，另方面进行政治宣传，这些司马多数由祖军自行任命，但也有将近三分之一是洛阳委派的其三，军中律令，改从关中军旧制当然啦，其实差别并不是太大。
至于其四，于收复失土，各郡县乃至亭的守吏，祖逖有署任权，但须报尚书省备案，尚书省亦可因应情势，加以更替。
原本在晋时，裴军在西，祖军在东，各练各兵，各打各仗，名为守望相助，其实相互间的联系并不紧密。既归华朝，就不能再这样了，华廷自然会徐徐地往祖军中塞人、掺沙子，以期逐步加以掌控。对于祖逖来说，你只要别太过份，别影响到我的对羯之战，虽感不满，也只有捏着鼻子认了。
正因为如此，对于前线将兵，或者祖逖本部，华廷还不便也不敢过多地伸手，而于屯河内的李矩、驻枋头的魏亥，人员安插和调动就相对要频繁一些李、魏二人皆为故晋旧将，原本就不是祖家军的核心人马，二将也因此颇有改换门庭的想法，故于枢密省的安排并无异议。
即以魏亥论，他的旅司马，以及其下三位营司马，就全都是关西人此外枢密省还以其旅数量不全为由，新塞了五百多关西老兵进来。然而司马普遍比各部主官要低两级，魏亥为少将，其旅司马则是上校。
故而此际得报：“枢密省兵部侍郎杨清奉诏来到……”魏亥就不禁诧异啊，心说一部侍郎为正四品，军衔大校，但我知道这个杨清，他迎娶了皇后义妹，封襄邑县侯，乃是天子心腹，本衔少将，以高品而“行”兵部侍郎。这家伙跟我同品，爵位还比我高一级，他到前线来干什么？难道是朝廷欲罢我之职，而以杨清代之吗？
心中忐忑，赶紧出营相迎。
只见一队人马列于营前，当先一将，见魏亥出来便即下马，倒执马鞭，拱手道：“足下可是魏将军么？末乃杨清。”
魏亥上下打量杨清，就见此人年纪很轻，估摸着还不到三十岁，与郭诵差相仿佛，却比自家为小。虽说也是行武出身，但或许这几年一直安坐后方的缘故吧，杨清肤色颇为白皙，和魏亥、郭诵这种久在军中，常冒风霜烈日的将领，一眼就能区分出来。
杨清未穿甲胄，身上是一套黑质镶红的戎服，腰围金带，佩着紫绶。至于头上，则戴了一顶黑色的皮弁，正中央镶嵌着一枚五角金星……
魏亥不禁心说，这打扮很威风啊，我也应当去置备一套。
魏晋时军将，与文吏相同，都规定了四时之祭服、礼服，却并未规定常服，所谓上身褶衣、下身长裤的戎服，多不是在正规场合所可穿着的。理论上要到晋安帝时代，才下诏：“诸侍官戎行之时，不备朱衣，悉令袴褶从也。”武官，或者文官行武事时，才算有常服制度。而在此之前，武将于军中并无统一服色，往往是怎么穿着舒服就怎么来。
华朝则只定一套祭服，和一套公服合礼服与常服为一，但新建制度，自然不可能下令全军即刻换装光换旗帜就是一个大工程了朝廷只是赏赐了祖逖一套常服而已，魏亥等将则还来不及置换。此外按制，元帅、元戎当配金钺盔饰，各级将校以金银等做星形盔饰，尉官以铜做扣形盔饰，以别上下、明号令，但祖逖认为这纯属浪费金钱的面子工程，他素来俭朴，乃不即配，上行下效，魏亥等自然也不敢配了。
故此魏亥今日见杨清袴褶精神、金星煌煌，不禁眼热，相比起来，自家虽然着甲戴盔，却象是个乡巴佬了。当下听得杨清询问，面色乃微微一变，旋即恢复正常，拱手道：“末将正是魏亥，恭迎杨侍郎。”
杨清多敏的人啊，当即笑着一摆手，说：“魏将军在军中，想是尚未来得及制服。正好，朝廷赏赐将军一套公服，命我携来。”身后当即有小吏捧着具木匣疾驱而前。
杨清道：“可先入营，将军易了服，再来听杨某宣诏。”
魏亥忙将杨清等一行人接入营中，随即告罪请杨清稍待，他自己跑后面换衣服去了。过不多时，身着袴褶，足登皮靴，一手捧着皮弁，一手摩挲着其上的金星，转归正堂，等进门后才忙不迭地把弁给戴起来。
对面一站，双方打扮相若，两颗金星相向闪耀，魏亥还比杨清要高出半个头去他这才感觉通体舒泰。
而且趁着换衣服的片刻时间，魏亥也想明白了，固然杨清是天子近幸，终究未闻立过什么显赫的功劳啊，他一直在后方坐办公室呢。则若朝命使杨清替我，我就说军情方急，所任不可非人，把官司直接打到祖元帅面前去，多半还有转圜的余地……
杨清取诏来宣读，倒没有什么骈四俪六，文意还算浅显，魏亥大致能够听得懂原来是天子特命杨清到枋头来，协助魏亥调配粮秣物资的，并非要夺他的兵权。
魏亥这才把心放落肚中，就要下令摆宴为杨侍郎接风。杨清却摆手道：“此非饭时，何必摆宴啊？还是公事要紧。”旋即问道：“河道近日不甚通畅，导致粮运须走陆路，损耗既大，行进又迟缓，此事魏将军可知道了么？”
魏亥苦笑道：“魏某正为此事焦虑。祖元帅方与羯贼对战于三台，军中日耗粮近五百斛，每日催促，而若西方之粮不能及时输至枋头，恐怕于军争不利啊……”
杨清就问了：“如今枋头存粮，尚有几许？”
魏亥虽然不是专搞后勤的，但既奉命护粮，于存粮数目须每日核点，自然也是清楚的，当即回复道：“不足两万斛，最多可资一个月。”
杨清当即蹙眉问道：“自祖元帅离开荥阳北渡，至今六十七日，前报军中储粮三万五千斛，国家又东输六万斛，则在某核计，即便算上运途中损耗，枋头亦当残存五万斛粮，可资两月有余，如何不足其半？难道说粮秣物资，多已转运往前线去了么？”
魏亥摇头道：“为蘷安常谋扰我粮运，故此前方不敢多储。临漳、安阳、荡阴等城，各不过二三千斛粮……”
杨清把手一摊：“则少的那些，何处去了？”
魏亥心说你啥意思，怀疑我贪污吗？面上不禁隐现怒气，当即命人将账册抱来，摊在案上，说：“账皆在此，杨侍郎若有不信，可自查断哪里会有两万斛粮的出入啊？”
杨清笑着拱手道：“魏将军勿动怒。将军国家宿将，自晋时即承乃叔之志，厮杀御羯，名闻天下，忠心可鉴，朝廷岂有怀疑将军之理啊？”随即正色道：“实话说与将军知道，不仅仅水运困难，导致后续粮秣来迟，且拓跋鲜卑方南侵太原，陶枢密已持节北行，督诸军往御矣。国家府库，必须供应东西两线战事，实已不堪重负。是以天子命我来此，协助将军，杨清别无所长，唯于军资调度上，有过一些经验……”
其实即便因应两线战事，如今洛阳及周边府库的存粮，也还够支撑大半年的，但你总得留点儿富裕吧，要备不时之急啊。本来裴该还担心，我若说粮食快没了，让祖家军你们省着点儿吃，祖逖会不会疑心是欲沮其功呢？正好拓跋南下，给了他足够充分的藉口。
杨清乃道：“祖元帅前上奏，期以三月，必败羯贼，则洛中再匮乏，天子亦命我等搜罗府库，必要填上这三月之需。但某实在为难，才不得不请命到枋头来，协助魏将军，务必使一粒粮、一束草，都能用到实处。”
随即一拍胸脯：“不是某夸口，昔在关中，供应太原之战，关中军供奉原本比贵军为厚，都能细加筹划，使足食足用。故今日来此，实为辅弼魏将军，绝无疑忌将军之意。”说着话手按案上的账册，说我先好好瞧瞧，不是查账，是为了寻找出可以节省的空间来，将军可允准否？
他话都说到这个份儿上了，魏亥又岂有不允之理？再者说了，我命人把账册抱出来，本来就是让你查的，反正天日昭昭，我问心无愧，不怕你鸡蛋里挑骨头。
可是谁想到杨清当即命人取来一把算盘，埋头伏案一个多时辰，还真被他给挑出了不少的“骨头”来……
算盘这种计算工具，起码在东汉末年就已经有了，数学家徐岳所撰数术记遗中就提到过：“珠算控带四时，经纬三才。”不过那时候的算盘跟后世差别很大，上下三格，每格一串五珠，故谓“经纬三才”，而且计算方法更接近于筹算，而不是宋代以后才定型的珠算。
裴该很注重军政两道的数字化管理当然啦，因为时代的限制，只能略得其意罢了但是自己可以打草稿，列算式，这法子却不便教给旁人一不小心把阿拉伯数字给漏出去，那就说不清啦。况且笔算速度终究不如珠算，所以他就搜索枯肠，“发明”了算盘，更把自己前世在小学时代练习过，却几乎忘光了的珠算口诀给“复原”了出来。
昔日长安行台，如今洛阳朝廷，凡事务小吏皆须学珠算，而品级最高的珠算能手，就得算是杨清了。当下他伏在案上，右手拨拉算珠，左手翻检账册，十指运转如风，其声有若急雨，当真瞧得魏亥是翘舌不下。
魏亥算是服气了。他自认也懂得一些数算，会摆算筹，所以祖逖才将护粮的重任交到他肩膀上。但一般情况下，具体账册都是下吏在做，数字由下吏统计，作为主官，魏亥顶多抽查罢了。没想到一个跟自己同级的将官，竟然算起账来比那些积年老吏还快速，果然天子重用此人，并不仅仅因为裙带关系啊……
等到杨清算完了账，便即把自己做了标记的几十处地方，逐一指点给魏亥看，并且详加解释。通过这次核账，魏亥揪出了军中两名欺上瞒下、贪污粮饷的蠧虫那两名小吏自认为账目做得滴水不漏，将军难以看出漏洞，但在杨清有理有据的喝问下，也不得不当场伏罪了。
魏亥即命将此二獠推出辕门斩首。
可是两名小吏又能贪污多少呢？即便追缴回来，也不过六七百斛粮食而已。魏亥就质问杨清：“侍郎云差额两万斛左右，余数何在？”
杨清当即笑笑，说我还没跟你讲完呢，这六七百斛，乃是人为的损耗，其余那些，则属于自然损耗，但完全可以弥补！
即将各旅乃至各营、各部所须粮草数量，与魏亥实际拨给的，逐一比对，其结果是，将军你计算损耗太宽，这才给了某些不逞之徒下手的机会
“将军营中，犯律者不过二吏，焉知他军中便无？若将途中损耗核计得更确实，则彼等便难寻贪墨的机会方自激战，若将士粮草遭克扣，岂有不及时禀报司马的道理啊？祖元帅军法甚言，岂能不展开彻查？”
进而在粮草的管理和运路的统筹上，也还有可商榷之处“某以为，粮勿远运，远运则兵卒疲累，难免失误，且伕役多携口粮，于途中损耗也大。不如自枋头而朝歌，自朝歌而荡阴，自荡阴而安阳，自安阳而临漳，分途押运。某昔在关中，亦曾行此策，但规划得法，途中损耗，可少二三成。”
魏亥就问了：“之所以不多储粮于安阳、荡阴等处，是恐羯贼骚扰断道，若如侍郎所言，倘有错失，如何处啊？”
杨清笑道：“粮在途中，自然易失，若入储于城，则何所失啊？倘若羯贼绕路而来，复陷诸城，则我军后路断绝，自然溃败何必顾虑粮落贼手？”
完了又笑笑说：“至于如何统筹兵马，警护粮运，此将军之责也，杨某又岂敢置喙？”我真是来帮着调度粮草的，兵权还在你手里，你说了算估计我命中就照着全军覆没的灾星，若无必要，可再不敢亲自领兵了……